Fattore ambientale

Il National Institutes of Health (NIH) ha una nuova politica di gestione e condivisione dei dati che richiede a tutti i ricercatori finanziati dal NIH di creare, implementare e segnalare un piano NIH di gestione e condivisione dei dati (DMS). La nuova politica, entrata in vigore il 25 gennaio, mira a garantire che la ricerca finanziata dai contribuenti sia resa pubblica. Il piano DMS presenta sei elementi che aiuteranno a spostare i dati della ricerca governativa verso i principi FAIR (trovabili, accessibili, interoperabili e riutilizzabili).

Per aiutare i ricercatori nel campo delle scienze della salute ambientale con il nuovo mandato, la NIEHS Environmental Health Language Collaborative (EHLC) ha ospitato tre workshop di mezza giornata intitolati “Condividere i dati delle scienze della salute ambientale: metadati, standard e strumenti”.

"Lo scopo dei workshop era quello di aumentare la consapevolezza e incoraggiare l'uso di metadati, standard e strumenti che i ricercatori possono utilizzare per conformarsi alla nuova politica del 2023", ha affermato Stephanie Holmgren, responsabile del programma presso l'Ufficio di scienza dei dati del NIEHS e presidente di il comitato di pianificazione del programma del workshop. "I workshop erano destinati a chiunque svilupperà o implementerà il piano di gestione e condivisione dei dati NIH o che è interessato a imparare come gestire, condividere e riutilizzare in modo efficace i dati delle scienze della salute ambientale."

In linea con la missione dell'EHLC, l'obiettivo della serie di workshop era aiutare i ricercatori nel campo delle scienze della salute ambientale a rispettare gli elementi uno (descrizioni dei dati) e tre (standard) dei sei elementi politici richiesti da includere in un piano DMS. Le presentazioni riguardavano gli strumenti per l'annotazione dei metadati e includevano informazioni su come trovare e utilizzare ontologie e vocabolari controllati rilevanti per la ricerca sulle scienze della salute ambientale.

Lo scopo del primo elemento del Piano DMS è quello di applicare descrizioni dettagliate e convenzioni di denominazione che aiutino nella ricerca dei dati. In particolare, è previsto l'inserimento di dettagli sui metadati. I metadati sono dati che forniscono informazioni aggiuntive destinate a rendere i dati scientifici interpretabili e riutilizzabili.

Ad esempio, tutti i dati verranno archiviati in repository e le descrizioni standardizzate aiuteranno con annotazioni, funzionalità di ricerca ed estrazione di informazioni. Avendo questa terminologia coerente, i dati dello studio possono essere riutilizzati e interoperabili.

"I metadati sono estremamente importanti perché aiutano a comunicare come sono stati generati i dati e di cosa trattano", ha affermato Holmgren. “Quindi, non solo un altro essere umano può comprendere quei dati, ma anche le macchine possono comprenderli. Con la potenza delle macchine, possiamo fare molto di più con i dati in termini di inferenza o di osservazione di modelli nei dati, consentendo così ai ricercatori di affrontare questioni più complesse”.

Oltre a descrizioni chiare, è necessaria anche la necessità di sviluppo comunitario, consenso e adozione di standard su come dovrebbero essere strutturati i dati delle scienze della salute ambientale.

"Per rendere i dati CORRETTI, è davvero necessario disporre di buoni metadati, e questi buoni metadati si ottengono quando si hanno standard di metadati approvati dalla comunità", ha affermato Mark Musen, MD, Ph.D., dell'Università di Stanford, durante una presentazione del workshop .

La serie ha evidenziato gli standard fondamentali relativi alle scienze della salute ambientale e le migliori pratiche dettagliate su cosa fare se non esistono standard per aspetti specifici di uno studio di ricerca.

"Riconosciamo che ogni studio è unico e avrà i suoi aspetti, ma c'è ancora qualche denominatore comune fondamentale nella natura di uno studio di tossicologia riproduttiva o di uno studio di epidemiologia ambientale", ha detto Holmgren.

L’attuazione del Piano DMS prevede la condivisione dei dati.

“Non è più sufficiente dire: 'I dati verranno condivisi su richiesta'. Ora esiste l’obbligo di inviare effettivamente i dati in un archivio”, ha affermato Holmgren.

Le migliori pratiche per la condivisione del repository includono quanto segue.

“Al centro della nuova politica, si tratta davvero di cercare di trasmettere il valore del motivo per cui la condivisione dei dati è importante”, ha affermato Holmgren. “Se intendi condividere correttamente i dati, devi gestirli in modo efficace. I due sono strettamente collegati perché la gestione dei dati avviene durante tutto il ciclo di vita della ricerca. Il Piano DMS aiuta i ricercatori a pensare in anticipo ai problemi di gestione e condivisione dei dati prima di condurre uno studio”.